Jag skulle bestämt avråda från detta förhållningssätt. Förvisso blir FileMakers reparationsfunktion bättre för varje version MEN en databas som reparerats har endast som syfte att möjliggöra en import av datamängden från denna fil till en okrashad kopia.

"Det finns ingen garanti för att ett skadad databas som repareras blir lika bra som en som aldrig varit skadad"

Så en automatisk funktion skulle snarast i ditt fall vara: Databasen skadas, reparera den skadade databasen. Ta fram en oskadad tom kopia och importera in alla data från den reparerade filen. Ta bort den skadade och den reparerade...

Problematiken finns ju inte alls i samma avseende med FileMaker Server, eftersom servern tar backup under drift och kan backa var 5:e minut om det skulle vara nödvändigt. Kraschar servern, så tar man senaste backup. Punkt slut. (Och automatisk omstart på servern är inget bra koncept)

Se mer information på : http://filemaker.custhelp.com/app/answers/detail/a_id/7336/kw/corrupt

(Men för att svara på din primära fråga borde det gå att lösa filhanteringsfrågan med ett bat-script (Win) eller Applescript/Automator (Mac). - eller inifrån FileMaker med plug-iner som Troi File, eller SMTP-it)